学院设置教学、科研与管理机构有:系、教研室、各类教学科研平台、研究所、学院管理机构以及工会、分团委、学生会、学生自律会等群团组织。

系:食品科学与工程系、生物工程系、环境工程系。

教研室:化学教研室。

教学科研平台:水产品深加工技术国家地方联合工程中心、国家级海洋食品加工与安全研究生实践教育示范基地、福建省食品微生物与酶工程重点实验室、福建省海洋功能食品工程技术研究中心、福建省海洋生物资源开发利用协同创新中心、福建省生命科学基础教学示范中心、厦门市食品生物工程技术研究中心、厦门市食品科技研发检测中心、厦门市海洋功能食品重点实验室、食品与生物工程综合实验室。

研究所:集美大学环境工程研究所。

管理机构:学院办公室

联系电话:

院办(行政) 6181487 传真 6180470;

院办(教学) 6181774、6180638 传真 6181774;

院办(学生) 6180546 传真 6180546;

院分团委 6182950